东西引荐 SDMap：让药物反响可视化的空间数据库（一）
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成功案例 发布时间：2025-12-16 13:52:56
。同一药物在安排不一样的区域常出现天壤之别的表达和功用成果，例如：缺氧区域耐药、血管富集区域灵敏、免疫微环境区域反响增强或按捺。因而，药物研讨急需：在空间尺度上描写药物影响的实在反响。
SDMap 是第一个体系整合“药物处理后的空间转录组数据”的归纳数据库，为不同药物构建空间扰动图谱（spatial drug perturbation maps）。
空间spot QC、区域注释与结构分区、药物差异基因辨认、通路富集、空间药物反响轨道构建、细胞间信号网络改动剖析
D-SPGs 界说为：在空间区域中对药物影响出现明显、区域性改动的基因。它提醒两层信息：药物反响、空间方位依靠性反响，这是SDMap 最大立异点。
相似pseudotime，但在空间维度上：显现药物效应沿安排架构怎么“传达”、哪些区域更早或更晚呼应、哪些区域构成耐药屏障。用于提醒药物效应的空间动力学。
包含：细胞间通讯改动（ligand–receptor）、区室间药物调控差异、药物对微环境结构性单元（niches）的影响。着重药物效应是体系级、空间依靠的。
SDMap 将“药物扰动研讨”从无空间提升到有空间，从细胞层面拓宽到微环境层面，为了解药物体内实在效果机制供给了全新的维度。